| | Nn temaatiline üldprogramm | Lõuna-Soome ja Eesti allprogramm | Saarte ja saarestike allprogramm |
Prioriteet 1: Turvaline ja tervislik elukeskkond | keskkonnateadlikkuse tõstmine, keskkonnaalaste teadmiste vahetamine | looduskeskkonna säilitamine ja parendamine | keskkonnateadlikkuse tõstmine |
| | jätkusuutlik ruumiline planeerimine ja keskkonna juhtimine | vastutus füüsilise keskkonna eest | jätkusuutliku infrastruktuuri toetamine |
| Prioriteet 2: Majanduslikult konkurentsivõimeline ja innovaatiline regioon | innovatsiooni ja konkurentsivõime parendamine | loov ja toetav innovaatiline ja konkurentsivõimeline keskkond | jätkusuutlik turism ja teadmistepõhine majandus |
| | piirkonna sisese ja välise ligipääsetavuse parendamine | ühenduste parendamine programmipiirkonnas | saartele ja saarestikele juurdepääsu parendamine ning informatsiooni jagamine |
| | tööjõuturu potentsiaali optimeerimine | vastamine tööjõuturu väljakutsetele | saarte- ja saarestikepõhiste majandustegevuste edendamine (nt traditsiooniline väikepõllumajandus, kalandus, käsitöö, mereline pärand jms.) |
| Prioriteet 3: Atraktiivsed ja dünaamilised kogukonnad | elutingimuste ja sotsiaalse kaasatuse parendamine | erinevate ühiskonnagruppide sotsiaalse turvalisuse ja heaolu parendamine | (eelkõige noortega seotud) sotsiaalsete ja demograafiliste probleemide lahendamine |
| | kultuurivahetuse tihendamine | pärandi ja kultuuri edendamine ning kaitse | |